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CHARACTERIZATION OF THE REPETITIVE COMPONENT OF THE FIG (FICUS CARICA) GENOME
2016-01-01 Usai, Gabriele; Mascagni, Flavia; Zuccolo, A; Giordani, Tommaso; Natali, Lucia; Cavallini, Andrea
A draft genome sequence of the fig (Ficus carica L.)
2017-01-01 Usai, G.; Solorzano Zambrano, L.; Vangelisti, A.; Mascagni, F.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; Giordani, T.; Natali, L.; Cavallini, A.
Transcriptome comparison between two fig (Ficus carica L.) cultivars
2017-01-01 Usai, G.; Vangelisti, A.; Solorzano Zambrano, L.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Cavallini, A.; Natali, L.
Cultivar-specific transcriptome prediction and annotation in Ficus carica L.
2017-01-01 Solorzano Zambrano, L.; Usai, G.; Vangelisti, A.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Bernardi, R.; Cavallini, A.; Gucci, R.; Caruso, G.; D'Onofrio, C.; Quartacci, M. F.; Picciarelli, P.; Conti, B.; Lucchi, A.; Natali, L.
Comparative genome-wide analysis of repetitive DNA in the genus Populus L.
2017-01-01 Usai, G.; Mascagni, F.; Natali, L.; Giordani, T.; Cavallini, A.
A comparison of methods for LTR-retrotransposon insertion time profiling in the Populus trichocarpa genome
2018-01-01 Mascagni, Flavia; Usai, Gabriele; Natali, L.; Cavallini, A.; Giordani, T.
Deciphering the genome of a highly heterozygous, nonmodel species, Ficus carica L., using long-read sequencing.
2018-01-01 Usai, G.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; King, R.; HASSANI-PAK, K.; Natali, L.; Cavallini, A.
Deciphering the molecular basis of salinity tolerance in fig tree (Ficus carica L.).
2018-01-01 Vangelisti, A.; SOLORZANO-ZAMBRANO, L.; Usai, G.; Bernardi, R.; Mascagni, F.; Caruso, G.; Cavallini, A.; Gucci, R.; Natali, L.; Giordani, T.
Ligulate inflorescence of Helianthus x multiflorus, cv. Soleild’Or, correlates with a mis-regulation of a CYCLOIDEA gene characterised by insertion of a transposable element
2018-01-01 Fambrini, M.; Bellanca, M.; Costa Muñoz, M.; Usai, G.; Cavallini, A.; Pugliesi, C.
High-quality, haplotype-phased de novo assembly of the highly heterozygous fig genome, a major genetic resource for fig breeding.
2019-01-01 Usai, G.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Vangelisti, A.; Bosi, E.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; King, R.; Hassani-Pak, K.; Solorzano Zambrano, L.; Cavallini, A.; Natali, L.
De novo assembly of the highly heterozygous fig (Ficus carica L.) genome reveals epigenetic patterns.
2019-01-01 Usai, G.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Vangelisti, A.; Bosi, E.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; King, R.; HASSANI-PAK, K.; SOLORZANO ZAMBRANO, L.; Cavallini, A.; Natali, L.
A long-read phased assembly of the highly heterozygous fig (Ficus carica L.) genome reveals epigenetic patterns.
2019-01-01 Usai, G.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Vangelisti, A.; Bosi, E.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; King, R.; Hassani-Pak, K.; Solorzano Zambrano, L.; Cavallini, A.; Natali, L.
Expression of sugars biosynthesis-related genes during fruit ripening in normal and salt-exposed fig plants.
2019-01-01 Fattorini, C.; Mascellani, A.; Vangelisti, A.; Usai, G.; Gucci, R.; Caruso, G.; Cavallini, A.; Natali, L.; Bernardi, R.
A whole genome analysis of long-terminal-repeat retrotransposon transcription in leaves of Populus trichocarpa L. Subjected to different stresses
2019-01-01 Vangelisti, A.; Usai, G.; Mascagni, F.; Natali, L.; Giordani, T.; Cavallini, A.
How an ancient, salt-tolerant fruit crop, Ficus carica L., copes with salinity: a transcriptome analysis
2019-01-01 Vangelisti, A.; Solorzano Zambrano, L.; Caruso, G.; Macheda, D.; Bernardi, R.; Usai, G.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Gucci, R.; Cavallini, A.; Natali, Lucia
A meta-analysis of the expression of HaCRE1, a young Copia LTR-retrotransposon of sunflower (Helianthus annuus L.)
2019-01-01 Vangelisti, A.; Mascagni, F.; Usai, G.; Giordani, T.; Natali, L.; Cavallini, A.
Do environmental changes induce retrotransposon expression in plants?
2019-01-01 Mascagni, F.; Vangelisti, A.; Usai, G.; Giordani, T.; Natali, L.; Cavallini, Andrea
The plastic genome: The impact of transposable elements on gene functionality and genomic structural variations
2020-01-01 Fambrini, M.; Usai, G.; Vangelisti, A.; Mascagni, F.; Pugliesi, C.
A computational genome-wide analysis of long terminal repeats retrotransposon expression in sunlower roots (Helianthus annuus L.)
2020-01-01 Mascagni, F; Vangelisti, A; Usai, G; Giordani, T; Cavallini, A; Natali, L
On the trail of tetu1: Genome-wide discovery of CACTA transposable elements in sunflower genome
2020-01-01 Ventimiglia, M.; Pugliesi, C.; Vangelisti, A.; Usai, G.; Giordani, T.; Natali, L.; Cavallini, A.; Mascagni, F.
| Titolo | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
|---|---|---|---|
| CHARACTERIZATION OF THE REPETITIVE COMPONENT OF THE FIG (FICUS CARICA) GENOME | 1-gen-2016 | Usai, Gabriele; Mascagni, Flavia; Zuccolo, A; Giordani, Tommaso; Natali, Lucia; Cavallini, Andrea | |
| A draft genome sequence of the fig (Ficus carica L.) | 1-gen-2017 | Usai, G.; Solorzano Zambrano, L.; Vangelisti, A.; Mascagni, F.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; Giordani, T.; Natali, L.; Cavallini, A. | |
| Transcriptome comparison between two fig (Ficus carica L.) cultivars | 1-gen-2017 | Usai, G.; Vangelisti, A.; Solorzano Zambrano, L.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Cavallini, A.; Natali, L. | |
| Cultivar-specific transcriptome prediction and annotation in Ficus carica L. | 1-gen-2017 | Solorzano Zambrano, L.; Usai, G.; Vangelisti, A.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Bernardi, R.; Cavallini, A.; Gucci, R.; Caruso, G.; D'Onofrio, C.; Quartacci, M. F.; Picciarelli, P.; Conti, B.; Lucchi, A.; Natali, L. | |
| Comparative genome-wide analysis of repetitive DNA in the genus Populus L. | 1-gen-2017 | Usai, G.; Mascagni, F.; Natali, L.; Giordani, T.; Cavallini, A. | |
| A comparison of methods for LTR-retrotransposon insertion time profiling in the Populus trichocarpa genome | 1-gen-2018 | Mascagni, Flavia; Usai, Gabriele; Natali, L.; Cavallini, A.; Giordani, T. | |
| Deciphering the genome of a highly heterozygous, nonmodel species, Ficus carica L., using long-read sequencing. | 1-gen-2018 | Usai, G.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; King, R.; HASSANI-PAK, K.; Natali, L.; Cavallini, A. | |
| Deciphering the molecular basis of salinity tolerance in fig tree (Ficus carica L.). | 1-gen-2018 | Vangelisti, A.; SOLORZANO-ZAMBRANO, L.; Usai, G.; Bernardi, R.; Mascagni, F.; Caruso, G.; Cavallini, A.; Gucci, R.; Natali, L.; Giordani, T. | |
| Ligulate inflorescence of Helianthus x multiflorus, cv. Soleild’Or, correlates with a mis-regulation of a CYCLOIDEA gene characterised by insertion of a transposable element | 1-gen-2018 | Fambrini, M.; Bellanca, M.; Costa Muñoz, M.; Usai, G.; Cavallini, A.; Pugliesi, C. | |
| High-quality, haplotype-phased de novo assembly of the highly heterozygous fig genome, a major genetic resource for fig breeding. | 1-gen-2019 | Usai, G.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Vangelisti, A.; Bosi, E.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; King, R.; Hassani-Pak, K.; Solorzano Zambrano, L.; Cavallini, A.; Natali, L. | |
| De novo assembly of the highly heterozygous fig (Ficus carica L.) genome reveals epigenetic patterns. | 1-gen-2019 | Usai, G.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Vangelisti, A.; Bosi, E.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; King, R.; HASSANI-PAK, K.; SOLORZANO ZAMBRANO, L.; Cavallini, A.; Natali, L. | |
| A long-read phased assembly of the highly heterozygous fig (Ficus carica L.) genome reveals epigenetic patterns. | 1-gen-2019 | Usai, G.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Vangelisti, A.; Bosi, E.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; King, R.; Hassani-Pak, K.; Solorzano Zambrano, L.; Cavallini, A.; Natali, L. | |
| Expression of sugars biosynthesis-related genes during fruit ripening in normal and salt-exposed fig plants. | 1-gen-2019 | Fattorini, C.; Mascellani, A.; Vangelisti, A.; Usai, G.; Gucci, R.; Caruso, G.; Cavallini, A.; Natali, L.; Bernardi, R. | |
| A whole genome analysis of long-terminal-repeat retrotransposon transcription in leaves of Populus trichocarpa L. Subjected to different stresses | 1-gen-2019 | Vangelisti, A.; Usai, G.; Mascagni, F.; Natali, L.; Giordani, T.; Cavallini, A. | |
| How an ancient, salt-tolerant fruit crop, Ficus carica L., copes with salinity: a transcriptome analysis | 1-gen-2019 | Vangelisti, A.; Solorzano Zambrano, L.; Caruso, G.; Macheda, D.; Bernardi, R.; Usai, G.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Gucci, R.; Cavallini, A.; Natali, Lucia | |
| A meta-analysis of the expression of HaCRE1, a young Copia LTR-retrotransposon of sunflower (Helianthus annuus L.) | 1-gen-2019 | Vangelisti, A.; Mascagni, F.; Usai, G.; Giordani, T.; Natali, L.; Cavallini, A. | |
| Do environmental changes induce retrotransposon expression in plants? | 1-gen-2019 | Mascagni, F.; Vangelisti, A.; Usai, G.; Giordani, T.; Natali, L.; Cavallini, Andrea | |
| The plastic genome: The impact of transposable elements on gene functionality and genomic structural variations | 1-gen-2020 | Fambrini, M.; Usai, G.; Vangelisti, A.; Mascagni, F.; Pugliesi, C. | |
| A computational genome-wide analysis of long terminal repeats retrotransposon expression in sunlower roots (Helianthus annuus L.) | 1-gen-2020 | Mascagni, F; Vangelisti, A; Usai, G; Giordani, T; Cavallini, A; Natali, L | |
| On the trail of tetu1: Genome-wide discovery of CACTA transposable elements in sunflower genome | 1-gen-2020 | Ventimiglia, M.; Pugliesi, C.; Vangelisti, A.; Usai, G.; Giordani, T.; Natali, L.; Cavallini, A.; Mascagni, F. |
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