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Breast cancer is the most common cancer among women. Common variants at 27 loci have been identified as associated with susceptibility to breast cancer, and these account for ∼9% of the familial risk of the disease. We report here a meta-analysis of 9 genome-wide association studies, including 10,052 breast cancer cases and 12,575 controls of European ancestry, from which we selected 29,807 SNPs for further genotyping. These SNPs were genotyped in 45,290 cases and 41,880 controls of European ancestry from 41 studies in the Breast Cancer Association Consortium (BCAC). The SNPs were genotyped as part of a collaborative genotyping experiment involving four consortia (Collaborative Oncological Gene-environment Study, COGS) and used a custom Illumina iSelect genotyping array, iCOGS, comprising more than 200,000 SNPs. We identified SNPs at 41 new breast cancer susceptibility loci at genome-wide significance (P < 5 × 10 -8). Further analyses suggest that more than 1,000 additional loci are involved in breast cancer susceptibility.
Large-scale genotyping identifies 41 new loci associated with breast cancer risk
Michailidou, Kyriaki;Hall, Per;Gonzalez Neira, Anna;Ghoussaini, Maya;Dennis, Joe;Milne, Roger L.;Schmidt, Marjanka K.;Chang Claude, Jenny;Bojesen, Stig E.;Bolla, Manjeet K.;Wang, Qin;Dicks, Ed;Lee, Andrew;Turnbull, Clare;Rahman, Nazneen;Fletcher, Olivia;Peto, Julian;Gibson, Lorna;Dos Santos Silva, Isabel;Nevanlinna, Heli;Muranen, Taru A.;Aittomäki, Kristiina;Blomqvist, Carl;Czene, Kamila;Irwanto, Astrid;Liu, Jianjun;Waisfisz, Quinten;Meijers Heijboer, Hanne;Adank, Muriel;Van Der Luijt, Rob B.;Hein, Rebecca;Dahmen, Norbert;Beckman, Lars;Meindl, Alfons;Schmutzler, Rita K.;Müller Myhsok, Bertram;Lichtner, Peter;Hopper, John L.;Southey, Melissa C.;Makalic, Enes;Schmidt, Daniel F.;Uitterlinden, Andre G.;Hofman, Albert;Hunter, David J.;Chanock, Stephen J.;Vincent, Daniel;Bacot, François;Tessier, Daniel C.;Canisius, Sander;Wessels, Lodewyk F. A.;Haiman, Christopher A.;Shah, Mitul;Luben, Robert;Brown, Judith;Luccarini, Craig;Schoof, Nils;Humphreys, Keith;Li, Jingmei;Nordestgaard, Børge G.;Nielsen, Sune F.;Flyger, Henrik;Couch, Fergus J.;Wang, Xianshu;Vachon, Celine;Stevens, Kristen N.;Lambrechts, Diether;Moisse, Matthieu;Paridaens, Robert;Christiaens, Marie Rose;Rudolph, Anja;Nickels, Stefan;Flesch Janys, Dieter;Johnson, Nichola;Aitken, Zoe;Aaltonen, Kirsimari;Heikkinen, Tuomas;Broeks, Annegien;Veer, Laura J. Van'T;Van Der Schoot, C. Ellen;Guénel, Pascal;Truong, Thérèse;Laurent Puig, Pierre;Menegaux, Florence;Marme, Frederik;Schneeweiss, Andreas;Sohn, Christof;Burwinkel, Barbara;Zamora, M. Pilar;Perez, Jose Ignacio Arias;Pita, Guillermo;Alonso, M. Rosario;Cox, Angela;Brock, Ian W.;Cross, Simon S.;Reed, Malcolm W. R.;Sawyer, Elinor J.;Tomlinson, Ian;Kerin, Michael J.;Miller, Nicola;Henderson, Brian E.;Schumacher, Fredrick;Le Marchand, Loic;Andrulis, Irene L.;Knight, Julia A.;Glendon, Gord;Mulligan, Anna Marie;Lindblom, Annika;Margolin, Sara;Hooning, Maartje J.;Hollestelle, Antoinette;Van Den Ouweland, Ans M. W.;Jager, Agnes;Bui, Quang M.;Stone, Jennifer;Dite, Gillian S.;Apicella, Carmel;Tsimiklis, Helen;Giles, Graham G.;Severi, Gianluca;BAGLIETTO, LAURA;Fasching, Peter A.;Haeberle, Lothar;Ekici, Arif B.;Beckmann, Matthias W.;Brenner, Hermann;Müller, Heiko;Arndt, Volker;Stegmaier, Christa;Swerdlow, Anthony;Ashworth, Alan;Orr, Nick;Jones, Michael;Figueroa, Jonine;Lissowska, Jolanta;Brinton, Louise;Goldberg, Mark S.;Labrèche, France;Dumont, Martine;Winqvist, Robert;Pylkäs, Katri;Jukkola Vuorinen, Arja;Grip, Mervi;Brauch, Hiltrud;Hamann, Ute;Brüning, Thomas;Radice, Paolo;Peterlongo, Paolo;Manoukian, Siranoush;Bonanni, Bernardo;Devilee, Peter;Tollenaar, Rob A. E. M.;Seynaeve, Caroline;Van Asperen, Christi J.;Jakubowska, Anna;Lubinski, Jan;Jaworska, Katarzyna;Durda, Katarzyna;Mannermaa, Arto;Kataja, Vesa;Kosma, Veli Matti;Hartikainen, Jaana M.;Bogdanova, Natalia V.;Antonenkova, Natalia N.;Dörk, Thilo;Kristensen, Vessela N.;Anton Culver, Hoda;Slager, Susan;Toland, Amanda E.;Edge, Stephen;Fostira, Florentia;Kang, Daehee;Yoo, Keun Young;Noh, Dong Young;Matsuo, Keitaro;Ito, Hidemi;Iwata, Hiroji;Sueta, Aiko;Wu, Anna H.;Tseng, Chiu Chen;Van Den Berg, David;Stram, Daniel O.;Shu, Xiao Ou;Lu, Wei;Gao, Yu Tang;Cai, Hui;Teo, Soo Hwang;Yip, Cheng Har;Phuah, Sze Yee;Cornes, Belinda K.;Hartman, Mikael;Miao, Hui;Lim, Wei Yen;Sng, Jen Hwei;Muir, Kenneth;Lophatananon, Artitaya;Stewart Brown, Sarah;Siriwanarangsan, Pornthep;Shen, Chen Yang;Hsiung, Chia Ni;Wu, Pei Ei;Ding, Shian Ling;Sangrajrang, Suleeporn;Gaborieau, Valerie;Brennan, Paul;Mckay, James;Blot, William J.;Signorello, Lisa B.;Cai, Qiuyin;Zheng, Wei;Deming Halverson, Sandra;Shrubsole, Martha;Long, Jirong;Simard, Jacques;Garcia Closas, Montse;Pharoah, Paul D. P.;Chenevix Trench, Georgia;Dunning, Alison M.;Benitez, Javier;Easton, Douglas F.
2013-01-01
Abstract
Breast cancer is the most common cancer among women. Common variants at 27 loci have been identified as associated with susceptibility to breast cancer, and these account for ∼9% of the familial risk of the disease. We report here a meta-analysis of 9 genome-wide association studies, including 10,052 breast cancer cases and 12,575 controls of European ancestry, from which we selected 29,807 SNPs for further genotyping. These SNPs were genotyped in 45,290 cases and 41,880 controls of European ancestry from 41 studies in the Breast Cancer Association Consortium (BCAC). The SNPs were genotyped as part of a collaborative genotyping experiment involving four consortia (Collaborative Oncological Gene-environment Study, COGS) and used a custom Illumina iSelect genotyping array, iCOGS, comprising more than 200,000 SNPs. We identified SNPs at 41 new breast cancer susceptibility loci at genome-wide significance (P < 5 × 10 -8). Further analyses suggest that more than 1,000 additional loci are involved in breast cancer susceptibility.
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.