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Previous genome-wide association studies (GWAS) have identified six risk loci for renal cell carcinoma (RCC). We conducted a meta-analysis of two new scans of 5,198 cases and 7,331 controls together with four existing scans, totalling 10,784 cases and 20,406 controls of European ancestry. Twenty-four loci were tested in an additional 3,182 cases and 6,301 controls. We confirm the six known RCC risk loci and identify seven new loci at 1p32.3 (rs4381241, P = 3.1Ã10-10), 3p22.1 (rs67311347, P = 2.5Ã10-8), 3q26.2 (rs10936602, P = 8.8Ã10-9), 8p21.3 (rs2241261, P = 5.8Ã10-9), 10q24.33-q25.1 (rs11813268, P = 3.9Ã10-8), 11q22.3 (rs74911261, P = 2.1Ã10-10) and 14q24.2 (rs4903064, P = 2.2Ã10-24). Expression quantitative trait analyses suggest plausible candidate genes at these regions that may contribute to RCC susceptibility.
Genome-wide association study identifies multiple risk loci for renal cell carcinoma
Scelo, Ghislaine;Purdue, Mark P.;Brown, Kevin M.;Johansson, Mattias;Wang, Zhaoming;Eckel-Passow, Jeanette E.;Ye, Yuanqing;Hofmann, Jonathan N.;Choi, Jiyeon;Foll, Matthieu;Gaborieau, Valerie;Machiela, Mitchell J.;Colli, Leandro M.;Li, Peng;Sampson, Joshua N.;Abedi-Ardekani, Behnoush;Besse, Celine;Blanche, Helene;Boland, Anne;Burdette, Laurie;Chabrier, Amelie;Durand, Geoffroy;Le Calvez-Kelm, Florence;Prokhortchouk, Egor;Robinot, Nivonirina;Skryabin, Konstantin G.;Wozniak, Magdalena B.;Yeager, Meredith;Basta-Jovanovic, Gordana;Dzamic, Zoran;Foretova, Lenka;Holcatova, Ivana;Janout, Vladimir;Mates, Dana;Mukeriya, Anush;Rascu, Stefan;Zaridze, David;Bencko, Vladimir;Cybulski, Cezary;Fabianova, Eleonora;Jinga, Viorel;Lissowska, Jolanta;Lubinski, Jan;Navratilova, Marie;Rudnai, Peter;Szeszenia-Dabrowska, Neonila;Benhamou, Simone;Cancel-Tassin, Geraldine;Cussenot, Olivier;Baglietto, Laura;Boeing, Heiner;Khaw, Kay-Tee;Weiderpass, Elisabete;Ljungberg, Borje;Sitaram, Raviprakash T.;Bruinsma, Fiona;Jordan, Susan J.;Severi, Gianluca;Winship, Ingrid;Hveem, Kristian;Vatten, Lars J.;Fletcher, Tony;Koppova, Kvetoslava;Larsson, Susanna C.;Wolk, Alicja;Banks, Rosamonde E.;Selby, Peter J.;Easton, Douglas F.;Pharoah, Paul;Andreotti, Gabriella;Freeman, Laura E. Beane;Koutros, Stella;Albanes, Demetrius;Männistö, Satu;Weinstein, Stephanie;Clark, Peter E.;Edwards, Todd L.;Lipworth, Loren;Gapstur, Susan M.;Stevens, Victoria L.;Carol, Hallie;Freedman, Matthew L.;Pomerantz, Mark M.;Cho, Eunyoung;Kraft, Peter;Preston, Mark A.;Wilson, Kathryn M.;Gaziano, J. Michael;Sesso, Howard D.;Black, Amanda;Freedman, Neal D.;Huang, Wen-Yi;Anema, John G.;Kahnoski, Richard J.;Lane, Brian R.;Noyes, Sabrina L.;Petillo, David;Teh, Bin Tean;Peters, Ulrike;White, Emily;Anderson, Garnet L.;Johnson, Lisa;Luo, Juhua;Buring, Julie;Lee, I. -Min;Chow, Wong-Ho;Moore, Lee E.;Wood, Christopher;Eisen, Timothy;Henrion, Marc;Larkin, James;Barman, Poulami;Leibovich, Bradley C.;Choueiri, Toni K.;Lathrop, G. Mark;Rothman, Nathaniel;Deleuze, Jean-Francois;McKay, James D.;Parker, Alexander S.;Wu, Xifeng;Houlston, Richard S.;Brennan, Paul;Chanock, Stephen J.
2017-01-01
Abstract
Previous genome-wide association studies (GWAS) have identified six risk loci for renal cell carcinoma (RCC). We conducted a meta-analysis of two new scans of 5,198 cases and 7,331 controls together with four existing scans, totalling 10,784 cases and 20,406 controls of European ancestry. Twenty-four loci were tested in an additional 3,182 cases and 6,301 controls. We confirm the six known RCC risk loci and identify seven new loci at 1p32.3 (rs4381241, P = 3.1Ã10-10), 3p22.1 (rs67311347, P = 2.5Ã10-8), 3q26.2 (rs10936602, P = 8.8Ã10-9), 8p21.3 (rs2241261, P = 5.8Ã10-9), 10q24.33-q25.1 (rs11813268, P = 3.9Ã10-8), 11q22.3 (rs74911261, P = 2.1Ã10-10) and 14q24.2 (rs4903064, P = 2.2Ã10-24). Expression quantitative trait analyses suggest plausible candidate genes at these regions that may contribute to RCC susceptibility.
Scelo, Ghislaine; Purdue, Mark P.; Brown, Kevin M.; Johansson, Mattias; Wang, Zhaoming; Eckel-Passow, Jeanette E.; Ye, Yuanqing; Hofmann, Jonathan N.;...espandi
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.