BARGHINI, ELENA Statistiche

BARGHINI, ELENA  

DIPARTIMENTO DI SCIENZE AGRARIE, ALIMENTARI E AGRO-AMBIENTALI  

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The race between retrotransposons and tandem repeats for shaping genome structure. The case of Olea. 1-gen-2019 Mascagni, F.; Natali, L.; Barghini, E.; Ceccarelli, M.; Baldoni, L.; Trapero, C.; Giordani, T.; Cavallini, A.
Not only transposons: the peculiar evolution of olive genome structure. 1-gen-2018 Mascagni, F.; Natali, L.; Barghini, E.; Ceccarelli, M.; Baldoni, L.; Trapero, C.; Giordani, T.; Cavallini, A.
Supporting data for "The genome sequence and transcriptome of Potentilla micrantha and their comparison to Fragaria vesca (the woodland strawberry)". 1-gen-2018 Buti, Matteo; Moretto, Marco; Barghini, Elena; Mascagni, Flavia; Natali, Lucia; Brilli, Matteo; Lomsadze, Alexandre; Sonego, Paolo; Giongo, Lara; Alonge, Michael; Velasco, Riccardo; Varotto, Claudio; Surbanovski, Nada; Borodovsky, Mark; Ward, Judson A.; Engelen, Kristof; Cavallini, Andrea; Cestaro, Alessandro; James Sargent, Daniel
The genome sequence and transcriptome of Potentilla micrantha and their comparison to Fragaria vesca (the woodland strawberry) 1-gen-2018 Buti, Matteo; Moretto, Marco; Barghini, Elena; Mascagni, Flavia; Natali, Lucia; Brilli, Matteo; Lomsadze, Alexandre; Sonego, Paolo; Giongo, Lara; Alonge, Michael; Velasco, Riccardo; Varotto, Claudio; Šurbanovski, Nada; Borodovsky, Mark; Ward, Judson A.; Engelen, Kristof; Cavallini, Andrea; Cestaro, Alessandro; James Sargent, Daniel
An insight into structure and composition of the fig genome 1-gen-2017 Barghini, Elena; Mascagni, Flavia; Giordani, Tommaso; SOLORZANO ZAMBRANO, LICETH JANINA; Natali, Lucia; Cavallini, Andrea
Identification and characterisation of Short Interspersed Nuclear Elements in the olive tree (Olea europaea L.) genome 1-gen-2017 Barghini, Elena; Mascagni, Flavia; Natali, Lucia; Giordani, Tommaso; Cavallini, Andrea
A survey of variability in LTR-retrotransposon abundance and proximity to genes between wild and cultivated sunflower genotypes 1-gen-2015 Mascagni, Flavia; Barghini, Elena; Giordani, Tommaso; Cavallini, Andrea; Natali, Lucia
Analysis of the repetitive component and retrotransposon population in the genome of a marine angiosperm, Posidonia oceanica (L.) Delile. 1-gen-2015 Barghini, Elena; Mascagni, Flavia; Natali, Lucia; Giordani, Tommaso; Cavallini, Andrea
LTR retrotransposon dynamics in the evolution of the olive (Olea europaea) genome 1-gen-2015 Barghini, Elena; Natali, Lucia; Giordani, Tommaso; Cossu, ROSA MARIA; Scalabrin, S.; Cattonaro, F.; Simková, H.; Vrána, J.; Dolezel, J.; Morgante, M.; Cavallini, Andrea
Repetitive DNA and plant domestication: variation in copy number and proximity to genes of LTR-retrotransposons among wild and cultivated sunflower (Helianthus annuus) genotypes. 1-gen-2015 Mascagni, Flavia; Barghini, Elena; Giordani, Tommaso; Rieseberg, L. H.; Cavallini, Andrea; Natali, Lucia
Transcriptome analysis of response to drought in poplar interspecific hybrids 1-gen-2015 Barghini, Elena; Cossu, ROSA MARIA; Cavallini, Andrea; Giordani, Tommaso
Variability in LTR-retrotransposon redundancy and proximity to genes between sunflower cultivars and wild accessions. 1-gen-2015 Giordani, Tommaso; Mascagni, Flavia; Barghini, Elena; Cavallini, Andrea; Natali, Lucia
The Peculiar Landscape of Repetitive Sequences in the Olive (Olea europaea L.) Genome 1-gen-2014 Barghini, Elena; Natali, Lucia; Cossu, ROSA MARIA; Giordani, Tommaso; Pindo, M.; Cattonaro, F.; Scalabrin, S.; Velasco, R.; Morgante, M.; Cavallini, Andrea
A survey of the repetitive component of the olive (Olea europaea L.) genome. 1-gen-2013 Barghini, Elena; Cavallini, Andrea; Cossu, ROSA MARIA; Giordani, Tommaso; Pindo, M.; Cattonaro, F.; Scalabrin, S.; Velasco, R.; Morgante, M.; Natali, Lucia
The repetitive component of the sunflower genome as shown by different procedures for assembling next generation sequencing reads 1-gen-2013 Natali, Lucia; Cossu, ROSA MARIA; Barghini, Elena; Giordani, Tommaso; Buti, M.; Mascagni, Flavia; Morgante, M.; Gill, N.; Kane, N. C.; Rieseberg, L.; Cavallini, Andrea
Using different procedures for assembling next generation sequencing reads allows to obtain a complete description of the repetitive component of the sunflower genome. 1-gen-2013 Cossu, ROSA MARIA; Natali, Lucia; Barghini, Elena; Giordani, Tommaso; Buti, M.; Mascagni, Flavia; Rieseberg, L.; Kane, N. C.; Gill, N.; Morgante, M.; Cavallini, Andrea
NGS Analysis of LTR Retrotransposon Redundancy and Expression in Poplar Hybrids Subjected to Water Stress 1-gen-2012 Cossu, Rm; Giordani, Tommaso; Barghini, Elena; Marroni, F; Morgante, M; Bastien, C; Cavallini, Andrea; Natali, Lucia
Analysis of LTR retrotransposons in the genus Populus 1-gen-2011 Cossu, Rm; Giordani, Tommaso; Barghini, Elena; Marroni, F; Pinosio, S; Cattonaro, F; Morgante, M; Natali, Lucia; Cavallini, Andrea
Towards the construction of OLEAREP: a database of repeated sequences of Olea europaea L. 1-gen-2011 Barghini, Elena; Cossu, Rm; Giordani, Tommaso; Cattonaro, F; Morgante, M; Natali, Lucia; Cavallini, Andrea