MASCAGNI, FLAVIA Statistiche
MASCAGNI, FLAVIA
DIPARTIMENTO DI SCIENZE AGRARIE, ALIMENTARI E AGRO-AMBIENTALI
A chromosome-length genome assembly and annotation of blackberry (Rubus argutus, cv. “Hillquist”)
2022-01-01 Bruna, Tomas; Aryal, Rishi; Dudchenko, Olga; James Sargent, Daniel; Mead, Daniel; Buti, Matteo; Cavallini, Andrea; Hytonen, Timo; Andres, Javier; Pham, Melanie; Weisz, David; Mascagni, Flavia; Usai, Gabriele; Natali, Lucia; Bassil, Nahla; Fernandez, Gina E.; Lomsadze, Alexandre; Armour, Mitchell; Olukolu, Bode; Poorten, Thomas; Britton, Caitlin; Davik, Jahn; Ashrafi, Hamid; Lieberman Aiden, Erez; Borodovsky, Mark; Worthington, Margaret
A comparison of methods for LTR-retrotransposon insertion time profiling in the Populus trichocarpa genome
2018-01-01 Mascagni, Flavia; Usai, Gabriele; Natali, L.; Cavallini, A.; Giordani, T.
A computational comparative study of the repetitive DNA in the genus Quercus L
2020-01-01 Mascagni, Flavia; Vangelisti, Alberto; Giordani, Tommaso; Cavallini, Andrea; Natali, Lucia
A computational genome-wide analysis of long terminal repeats retrotransposon expression in sunlower roots (Helianthus annuus L.)
2020-01-01 Mascagni, F; Vangelisti, A; Usai, G; Giordani, T; Cavallini, A; Natali, L
A draft genome sequence of the fig (Ficus carica L.)
2017-01-01 Usai, G.; Solorzano Zambrano, L.; Vangelisti, A.; Mascagni, F.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; Giordani, T.; Natali, L.; Cavallini, A.
A long-read phased assembly of the highly heterozygous fig (Ficus carica L.) genome reveals epigenetic patterns.
2019-01-01 Usai, G.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Vangelisti, A.; Bosi, E.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; King, R.; Hassani-Pak, K.; Solorzano Zambrano, L.; Cavallini, A.; Natali, L.
A meta-analysis of the expression of HaCREl, a young Copia LTR-retrotransposon of sunflower (Helianthus annuus L.)
2019-01-01 Vangelisti, A.; Mascagni, F.; Usai, G.; Giordani, T.; Natali, L.; Cavallini, A.
A molecular characterization of the invasive fig weevil Aclees taiwanensis in Italy
2022-01-01 Bernardi, Rodolfo; Grossi, Lucia; Cavallini, Andrea; Mascagni, Flavia; Meregalli, Massimo; Carla PIERATTINI, Erika; Luigi SCARAMOZZINO, Pier; Lucchi, Andrea; Conti, Barbara
A survey of Gypsy and Copia LTR-retrotransposon superfamilies and lineages and their distinct dynamics in the Populus trichocarpa (L.) genome
2015-01-01 Natali, Lucia; Cossu, ROSA MARIA; Mascagni, Flavia; Giordani, Tommaso; Cavallini, Andrea
A survey of variability in LTR-retrotransposon abundance and proximity to genes between wild and cultivated sunflower genotypes
2015-01-01 Mascagni, Flavia; Barghini, Elena; Giordani, Tommaso; Cavallini, Andrea; Natali, Lucia
A whole genome analysis of long-terminal-repeat retrotransposon transcription in leaves of Populus trichocarpa L. Subjected to different stresses
2019-01-01 Vangelisti, A.; Usai, G.; Mascagni, F.; Natali, L.; Giordani, T.; Cavallini, A.
An insight into structure and composition of the fig genome
2017-01-01 Barghini, Elena; Mascagni, Flavia; Giordani, Tommaso; SOLORZANO ZAMBRANO, LICETH JANINA; Natali, Lucia; Cavallini, Andrea
Analysis of the repetitive component and retrotransposon population in the genome of a marine angiosperm, Posidonia oceanica (L.) Delile.
2015-01-01 Barghini, Elena; Mascagni, Flavia; Natali, Lucia; Giordani, Tommaso; Cavallini, Andrea
Arbuscular mycorrhizal fungi induce the expression of specific retrotransposons in roots of sunflower (Helianthus annuus L.)
2019-01-01 Vangelisti, Alberto; Mascagni, Flavia; Giordani, Tommaso; Sbrana, Cristiana; Turrini, Alessandra; Cavallini, Andrea; Giovannetti, Manuela; Natali, Lucia
Characterisation of LTR-Retrotransposons of Stevia rebaudiana and Their Use for the Analysis of Genetic Variability
2022-01-01 Simoni, S; Clemente, C; Usai, G; Vangelisti, A; Natali, L; Tavarini, S; Angelini, Lg; Cavallini, A; Mascagni, F; Giordani, T
CHARACTERIZATION OF THE REPETITIVE COMPONENT OF THE FIG (FICUS CARICA) GENOME
2016-01-01 Usai, Gabriele; Mascagni, Flavia; Zuccolo, A; Giordani, Tommaso; Natali, Lucia; Cavallini, Andrea
Comparative genome-wide analysis of repetitive DNA in the genus Populus L.
2017-01-01 Usai, G.; Mascagni, F.; Natali, L.; Giordani, T.; Cavallini, A.
Cultivar-specific transcriptome prediction and annotation in Ficus carica L.
2017-01-01 Solorzano Zambrano, L.; Usai, G.; Vangelisti, A.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Bernardi, R.; Cavallini, A.; Gucci, R.; Caruso, G.; D'Onofrio, C.; Quartacci, M. F.; Picciarelli, P.; Conti, B.; Lucchi, A.; Natali, L.
De novo assembly of the highly heterozygous fig (Ficus carica L.) genome reveals epigenetic patterns.
2019-01-01 Usai, G.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Vangelisti, A.; Bosi, E.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; King, R.; HASSANI-PAK, K.; SOLORZANO ZAMBRANO, L.; Cavallini, A.; Natali, L.
Deciphering the genome of a highly heterozygous, nonmodel species, Ficus carica L., using long-read sequencing.
2018-01-01 Usai, G.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; King, R.; HASSANI-PAK, K.; Natali, L.; Cavallini, A.
Titolo | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
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A chromosome-length genome assembly and annotation of blackberry (Rubus argutus, cv. “Hillquist”) | 1-gen-2022 | Bruna, Tomas; Aryal, Rishi; Dudchenko, Olga; James Sargent, Daniel; Mead, Daniel; Buti, Matteo; Cavallini, Andrea; Hytonen, Timo; Andres, Javier; Pham, Melanie; Weisz, David; Mascagni, Flavia; Usai, Gabriele; Natali, Lucia; Bassil, Nahla; Fernandez, Gina E.; Lomsadze, Alexandre; Armour, Mitchell; Olukolu, Bode; Poorten, Thomas; Britton, Caitlin; Davik, Jahn; Ashrafi, Hamid; Lieberman Aiden, Erez; Borodovsky, Mark; Worthington, Margaret | |
A comparison of methods for LTR-retrotransposon insertion time profiling in the Populus trichocarpa genome | 1-gen-2018 | Mascagni, Flavia; Usai, Gabriele; Natali, L.; Cavallini, A.; Giordani, T. | |
A computational comparative study of the repetitive DNA in the genus Quercus L | 1-gen-2020 | Mascagni, Flavia; Vangelisti, Alberto; Giordani, Tommaso; Cavallini, Andrea; Natali, Lucia | |
A computational genome-wide analysis of long terminal repeats retrotransposon expression in sunlower roots (Helianthus annuus L.) | 1-gen-2020 | Mascagni, F; Vangelisti, A; Usai, G; Giordani, T; Cavallini, A; Natali, L | |
A draft genome sequence of the fig (Ficus carica L.) | 1-gen-2017 | Usai, G.; Solorzano Zambrano, L.; Vangelisti, A.; Mascagni, F.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; Giordani, T.; Natali, L.; Cavallini, A. | |
A long-read phased assembly of the highly heterozygous fig (Ficus carica L.) genome reveals epigenetic patterns. | 1-gen-2019 | Usai, G.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Vangelisti, A.; Bosi, E.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; King, R.; Hassani-Pak, K.; Solorzano Zambrano, L.; Cavallini, A.; Natali, L. | |
A meta-analysis of the expression of HaCREl, a young Copia LTR-retrotransposon of sunflower (Helianthus annuus L.) | 1-gen-2019 | Vangelisti, A.; Mascagni, F.; Usai, G.; Giordani, T.; Natali, L.; Cavallini, A. | |
A molecular characterization of the invasive fig weevil Aclees taiwanensis in Italy | 1-gen-2022 | Bernardi, Rodolfo; Grossi, Lucia; Cavallini, Andrea; Mascagni, Flavia; Meregalli, Massimo; Carla PIERATTINI, Erika; Luigi SCARAMOZZINO, Pier; Lucchi, Andrea; Conti, Barbara | |
A survey of Gypsy and Copia LTR-retrotransposon superfamilies and lineages and their distinct dynamics in the Populus trichocarpa (L.) genome | 1-gen-2015 | Natali, Lucia; Cossu, ROSA MARIA; Mascagni, Flavia; Giordani, Tommaso; Cavallini, Andrea | |
A survey of variability in LTR-retrotransposon abundance and proximity to genes between wild and cultivated sunflower genotypes | 1-gen-2015 | Mascagni, Flavia; Barghini, Elena; Giordani, Tommaso; Cavallini, Andrea; Natali, Lucia | |
A whole genome analysis of long-terminal-repeat retrotransposon transcription in leaves of Populus trichocarpa L. Subjected to different stresses | 1-gen-2019 | Vangelisti, A.; Usai, G.; Mascagni, F.; Natali, L.; Giordani, T.; Cavallini, A. | |
An insight into structure and composition of the fig genome | 1-gen-2017 | Barghini, Elena; Mascagni, Flavia; Giordani, Tommaso; SOLORZANO ZAMBRANO, LICETH JANINA; Natali, Lucia; Cavallini, Andrea | |
Analysis of the repetitive component and retrotransposon population in the genome of a marine angiosperm, Posidonia oceanica (L.) Delile. | 1-gen-2015 | Barghini, Elena; Mascagni, Flavia; Natali, Lucia; Giordani, Tommaso; Cavallini, Andrea | |
Arbuscular mycorrhizal fungi induce the expression of specific retrotransposons in roots of sunflower (Helianthus annuus L.) | 1-gen-2019 | Vangelisti, Alberto; Mascagni, Flavia; Giordani, Tommaso; Sbrana, Cristiana; Turrini, Alessandra; Cavallini, Andrea; Giovannetti, Manuela; Natali, Lucia | |
Characterisation of LTR-Retrotransposons of Stevia rebaudiana and Their Use for the Analysis of Genetic Variability | 1-gen-2022 | Simoni, S; Clemente, C; Usai, G; Vangelisti, A; Natali, L; Tavarini, S; Angelini, Lg; Cavallini, A; Mascagni, F; Giordani, T | |
CHARACTERIZATION OF THE REPETITIVE COMPONENT OF THE FIG (FICUS CARICA) GENOME | 1-gen-2016 | Usai, Gabriele; Mascagni, Flavia; Zuccolo, A; Giordani, Tommaso; Natali, Lucia; Cavallini, Andrea | |
Comparative genome-wide analysis of repetitive DNA in the genus Populus L. | 1-gen-2017 | Usai, G.; Mascagni, F.; Natali, L.; Giordani, T.; Cavallini, A. | |
Cultivar-specific transcriptome prediction and annotation in Ficus carica L. | 1-gen-2017 | Solorzano Zambrano, L.; Usai, G.; Vangelisti, A.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Bernardi, R.; Cavallini, A.; Gucci, R.; Caruso, G.; D'Onofrio, C.; Quartacci, M. F.; Picciarelli, P.; Conti, B.; Lucchi, A.; Natali, L. | |
De novo assembly of the highly heterozygous fig (Ficus carica L.) genome reveals epigenetic patterns. | 1-gen-2019 | Usai, G.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Vangelisti, A.; Bosi, E.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; King, R.; HASSANI-PAK, K.; SOLORZANO ZAMBRANO, L.; Cavallini, A.; Natali, L. | |
Deciphering the genome of a highly heterozygous, nonmodel species, Ficus carica L., using long-read sequencing. | 1-gen-2018 | Usai, G.; Mascagni, F.; Giordani, T.; Zuccolo, A.; Ceccarelli, M.; King, R.; HASSANI-PAK, K.; Natali, L.; Cavallini, A. |